První kroky k současné podobě Asociace profesionálních klubů ledního hokeje proběhly na začátku 90. let, kdy v souvislosti se společenskými a politickými změnami došlo i k zásadním změnám v řízení a zejména v ekonomickém zabezpečení sportu.
V roce 1990 nejprve vznikla Rada celostátní hokejové ligy, která působila v podstatě jako jedna z komisí České a slovenské federace ledního hokeje. Dalším krokem bylo v dubnu 1991 založení samostatného orgánu Sdružení oddílů a klubů federální hokejové ligy. V roce 1993 v souvislosti s rozdělením republiky došlo ke změně názvu na Sdružení oddílů a klubů extraligy ledního hokeje ČR (SOK ELH). Tento subjekt ukončil činnost 15.6.1994 a téhož dne byla založena Asociace profesionálních klubů ledního hokeje. Nově založený subjekt byl a je organizován jako zájmové sdružení právnických osob.
Účelem APK je organizace, řízení a rozvoj extraligy a zastupování jejich účastníků, stejně jako rozvoj a podpora vrcholového hokeje a výchova a podpora talentované mládeže pro účely ELH. Členy APK jsou všichni účastníci extraligy. Nejvyšším orgánem APK je valná hromada. Jejími členy jsou všichni členové Asociace (14 klubů). Valná hromada rozhoduje o všech podstatných věcech Asociace, schází se minimálně 3 x za rok.
Činnost APK mezi valnými hromadami řídí představenstvo APK tvořené prezidentem, viceprezidentem a třemi členy. Funkční období je čtyřleté.
